ポップアップページ内でアンカータグを用いてリンクを作っても、見た目はリンクになるものの、クリックしても何もおきません。 これはポップアップ内のコンテンツがページ遷移してしまうことを防ぐためのものだと思います。
ポップアップ内でのリンクをクリックした際に、新規タブが開いてページが表示される動作を期待するならば、単純にアンカーに target 要素を付与してやるだけで実現できます。
Screw-Axis
幸い HTML5 から target 属性は非推奨でもなくなったので、大手を振って(?)使うことが出来ます。